第二年，张居正与太监李芳合谋，上疏朝廷重新起用高拱。朱载坖与高拱是什么关系，当然同意了。高拱接旨后，在严冬腊月，日夜兼程，回到北京出任大学士，并掌管吏部。许多官员以前与高拱不和，他们支持徐阶，现在徐阶走了，“高汉三”又回来了，有些人特别紧张，这么一位强势的领导，以前又得罪过他，自己肯定不会有好下场了。胡应嘉听说高拱复出，直接吓死了，欧阳一敬也在辞职回家的半路上郁闷而亡。高拱赶紧派人放话，他愿意和大家齐心协力，把各项工作做好，不会搞大规模报复。
话虽如此，高拱对徐阶以及帮助徐阶弹劾他的海瑞仍然不满，专门找机会和徐阶作对，一定要好好地整一整他。徐阶退休后，在江南兼并土地，还放任子弟横行乡里，引起当地百姓憎恨。高拱亲自上疏批判徐阶，说徐阶既然退休了，那就是老同志，应该好好颐养天年。可是他倚仗自己的名望，管教不严，放任族人鱼肉乡里，掠夺民财，他家里的钱估计和皇帝的金库差不多了。这样的人，不处罚怎么行呢？